仪器外部清洁：不使用乙醇或其它有机溶剂擦洗仪器表面，可用干抹布擦拭表面，去除灰尘及残留液体。特别是散热风扇容易积灰，应用吸尘器及时清理，防止灰尘过多影响电子元件性能。运动轴表面需要保持清洁，可用干抹布擦拭表面，防止灰尘进入损坏运动轴。加热炉及样品盘需要保持清洁，防止硬物进入影响抓取精度或损坏样品瓶。
更换进样针：
进入仪器工作站中的调试模式，下滑至进样针三轴区域，点击“更换进样针”，待取样针三轴运动至进样针更换位置后，用6mm扳手拧松进样针螺纹，取下进样针，取一根新的进样针，一个针头压环，将针头压环放入进样针螺帽内，压环尖头朝外，将新的进样针装上，手拧紧后，用6mm扳手再拧半圈，进样针更换完成。长期不使用的顶空进样器取样针、进样针、载气入口应密封。
样品瓶的清洗：
样品瓶的洁净程度，在样品分析过程中，起到了关键性的作用，清洗样品瓶，能够避免许多不必要的分析问题。推荐的样品瓶清洗流程：将瓶内的样品冲洗掉，加超纯水超声波清洗一到三次，每次二十到三十分钟，或浸泡过夜，然后使用超纯水冲洗三次，置于鼓风干燥箱中烘烤一百二十分钟，根据样品瓶洁净程度设置温度，冷却后取出，置于无有机污染物的地方密封保存，或立即使用。对于盛装了含有大量污染物的样品，如含油样品、土壤样品等，可加入洗涤液配合试管刷刷洗，将残留在瓶壁上的污染物刷掉，超声波清洗后，再用超纯水冲洗。其它清洗方式有使用铬酸洗液、酸液或碱液等清洗干净，烘干后方能使用。
